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  • Vector NTI Suite 8.0
    序列綜合分析軟件——軟件中的大部分分析可以通過在數(shù)據(jù)庫中進行選定（數(shù)據(jù)）->分析->結(jié)果（顯示、保存和入庫）三步完成。
  • RNA Structure 3.5
    RNA二級結(jié)構(gòu)軟件——RNA Sturcture根據(jù)最小自由能原理，將Zuker的根據(jù)RNA一級序列預測RNA二級結(jié)構(gòu)的算法在軟件上實現(xiàn)。
  • Array Designer 2.0
    基因芯片引物設計——DNA微矩陣（microarray）軟件，批量設計DNA和寡核苷酸引物工具。
  • ArrayVision 7.0
    基因芯片綜合分析軟件——一種功能強大的商業(yè)版基因芯片分析軟件，不僅可以進行圖像分析，還可以進行數(shù)據(jù)處理，方便protocol的管理，功能強大。
  • ScanAlyze 2
    基因芯片閱讀圖像分析軟件——斯坦福的基因芯片基因芯片閱讀軟件，進行微矩陣熒光圖像分析，包括半自動定義格柵與像素點分析。輸出為分隔的文本格式，可很容易地轉(zhuǎn)化為任何數(shù)據(jù)庫。
  • Cluster
    對大量微矩陣數(shù)據(jù)組進行各種簇（Cluster)分析與其它各種處理的軟件，由Stanford大學編制。
  • TreeView 1.5
    基因芯片聚類圖形顯示——斯坦福開發(fā)的用來顯示Cluster軟件分析的圖形化結(jié)果。現(xiàn)已和Cluster成為了基因芯片處理的標準軟件。
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