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App Pro-02 定量蛋白質(zhì)組學(xué)

定量蛋白質(zhì)組學(xué)（Quantitative Proteomics）是對(duì)一個(gè)基因組表達(dá)的全部蛋白質(zhì)或一個(gè)復(fù)雜混合體系內(nèi)所有蛋白質(zhì)進(jìn)行精確鑒定和定量，可用于篩選和尋找任何因素引起的樣本之間的差異表達(dá)蛋白，結(jié)合生物信息學(xué)揭示細(xì)胞生理病理功能，同時(shí)也可對(duì)某些關(guān)鍵蛋白進(jìn)行定性和定量分析。 常用的技術(shù)包括：iTRAQ與Label-free?？梢罁?jù)樣本蛋白質(zhì)組定量結(jié)果通過統(tǒng)計(jì)學(xué)進(jìn)行差異表達(dá)分析。

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iTRAQ（isobaric tags for relative and absolute quantitation）技術(shù)是由AB SCIEX公司研發(fā)的一種體外同重同位素標(biāo)記的相對(duì)與絕對(duì)定量技術(shù)。該技術(shù)利用多種同位素試劑標(biāo)記蛋白多肽N末端或賴氨酸側(cè)鏈基團(tuán)，經(jīng)高精度質(zhì)譜儀串聯(lián)分析，可同時(shí)比較多達(dá)8種樣品之間的蛋白表達(dá)量，是近年來定量蛋白質(zhì)組學(xué)常用的高通量篩選技術(shù)。

Label-free：無標(biāo)簽標(biāo)記的定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究，依賴于繁雜的信息分析完成定量過程，主要有兩種：信號(hào)強(qiáng)度和譜圖計(jì)數(shù)法[1]。前者根據(jù)一級(jí)質(zhì)譜相關(guān)的肽段峰強(qiáng)度（Mass spectral peak intensity）、峰面積（Peak area）、液相色譜保留時(shí)間（LC retention time）等信息進(jìn)行定量分析；后者根據(jù)二級(jí)質(zhì)譜相關(guān)的每個(gè)蛋白鑒定到的肽段總次數(shù)（Peptide hide或Spectral counts）、所鑒定肽段的離子價(jià)位（Ion counts of identified peptides）等信息進(jìn)行定量分析。

Abiocenter具有蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)豐富的分析處理經(jīng)驗(yàn)。分析內(nèi)容涉及：原始數(shù)據(jù)蛋白鑒定分析，蛋白修飾分析，蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域分析，蛋白質(zhì)相互作用分析，蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)建模分析，采用分子動(dòng)力學(xué)模型預(yù)測(cè)蛋白-蛋白對(duì)接與蛋白-配體對(duì)接及其結(jié)合位點(diǎn)等。

蛋白質(zhì)組是對(duì)蛋白質(zhì)特別是其結(jié)構(gòu)和功能的大規(guī)模研究。蛋白質(zhì)組學(xué)比基因組學(xué)要復(fù)雜得多?；蚪M是相當(dāng)穩(wěn)定的實(shí)體，而蛋白質(zhì)組通過與基因組的相互作用而不斷發(fā)生著改變。一個(gè)生命體在其機(jī)體的不同部分以及生命周期的不同階段，其蛋白表達(dá)可能存在巨大的差異。

常用的定量蛋白組學(xué)技術(shù)有：iTRAQ技術(shù)，LC-MS/MS技術(shù)等。

iTRAQ技術(shù)，LC-MS/MS技術(shù)

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