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App Pro-02 定量蛋白質組學
定量蛋白質組學(Quantitative Proteomics)是對一個基因組表達的全部蛋白質或一個復雜混合體系內所有蛋白質進行精確鑒定和定量,可用于篩選和尋找任何因素引起的樣本之間的差異表達蛋白,結合生物信息學揭示細胞生理病理功能,同時也可對某些關鍵蛋白進行定性和定量分析。 常用的技術包括:iTRAQ與Label-free。可依據樣本蛋白質組定量結果通過統(tǒng)計學進行差異表達分析。
蛋白芯片, 定量蛋白質組學, iTRAQ, Label-free
iTRAQ(isobaric tags for relative and absolute quantitation)技術是由AB SCIEX公司研發(fā)的一種體外同重同位素標記的相對與絕對定量技術。該技術利用多種同位素試劑標記蛋白多肽N末端或賴氨酸側鏈基團,經高精度質譜儀串聯分析,可同時比較多達8種樣品之間的蛋白表達量,是近年來定量蛋白質組學常用的高通量篩選技術。
Label-free:無標簽標記的定量蛋白質組學研究,依賴于繁雜的信息分析完成定量過程,主要有兩種:信號強度和譜圖計數法[1]。前者根據一級質譜相關的肽段峰強度(Mass spectral peak intensity)、峰面積(Peak area)、液相色譜保留時間(LC retention time)等信息進行定量分析;后者根據二級質譜相關的每個蛋白鑒定到的肽段總次數(Peptide hide或Spectral counts)、所鑒定肽段的離子價位(Ion counts of identified peptides)等信息進行定量分析。
Abiocenter具有蛋白質組數據豐富的分析處理經驗。分析內容涉及:原始數據蛋白鑒定分析,蛋白修飾分析,蛋白質結構域分析,蛋白質相互作用分析,蛋白質結構建模分析,采用分子動力學模型預測蛋白-蛋白對接與蛋白-配體對接及其結合位點等。
蛋白質組是對蛋白質特別是其結構和功能的大規(guī)模研究。蛋白質組學比基因組學要復雜得多。基因組是相當穩(wěn)定的實體,而蛋白質組通過與基因組的相互作用而不斷發(fā)生著改變。一個生命體在其機體的不同部分以及生命周期的不同階段,其蛋白表達可能存在巨大的差異。
常用的定量蛋白組學技術有:iTRAQ技術,LC-MS/MS技術等。
iTRAQ技術,LC-MS/MS技術
質譜平臺
LC-MS/MS質譜平臺LC-MS/MS質譜平臺LC-MS/MS質譜平臺
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